COVID-19 påvisningstips

For å støtte påvisning av nytt koronavirus (COVID-19) og vaksineforskning og utvikling, har de amerikanske sentrene for sykdomskontroll og forebygging (CDC) og den kinesiske regjeringen fullført sekvensering av det nye koronavirusgenomet og sendt resultatene til den amerikanske NCBI GenBank ® database]. Nylig har IDT mottatt henvendelser fra forskere over hele verden om det nye koronavirusdeteksjonssettet. Følgende er en kort beskrivelse.

Amerikanske sentre for sykdomskontroll og -forebygging

US Centers for Disease Control and Prevention Test Kit * Målretter forskjellige steder på COVID-19 nukleokapsidproteinet (N-gen). De tre settene med primere / sonder i dette settet må kjøres samtidig med den interne kontrollen som er rettet mot det humane RNase P-genet. Totalt 4 qPCR-tester er nødvendige for hver pasientprøve.

1. Deteksjonssettet bruker en ett-trinns qPCR-reaksjon (det vil si revers transkripsjon og påfølgende qPCR-reaksjoner er fullført i samme trinn);

2. Alle 3 N-gentester kan bare betraktes som et positivt resultat når Cq 0010010 lt; 35;

3. Den interne kontrollreaksjonen til RNase P er nøkkelen. Cq 0010010 gt; 3 5 betyr at uttrekket av prøven ikke er bra, og eksperimentet må gjentas;

Se de siste amerikanske sentre for sykdomskontroll og forebygging COVID-19 RT-PCR Test Method Laboratory Guide for relevante dokumenter og eksperimentelle protokoller.

Sammenligning med andre testsett

Verdens helseorganisasjon (WHO)

Forsøksprogrammet fra Verdens helseorganisasjon er forskjellig fra det amerikanske Centers for Disease Control and Prevention eksperimentelle programmet. Verdens helseorganisasjon anbefaler tre qPCR-reaksjoner for å bekrefte om COVID-19 er smittet. Selv om dette er et komplett sett med eksperimentelle protokoller, er det ingen amerikansk CDC-testmetode som er raskere fordi den krever tre påfølgende tester og et positivt resultat må observeres før neste test. Den eksperimentelle protokollen er testet i følgende rekkefølge:

1. Coronavirus E-gen

2. RdRP-gen: målretting mot SARS-koronavirus og annet flaggermus-assosiert koronavirus

3. RdRP-gen: målrettet mot COVID-19

Kinesisk senter for sykdomskontroll og forebygging

Deteksjonssettet til det kinesiske senteret for sykdomskontroll og -forebygging anbefaler bruk av 2 sett med grunning / sonder. Gruppe 1 er mål ORF 1 ab, og gruppe 2 brukes for å bekrefte N-genet til COVID-19.

Kontrollgruppe

Foreløpig elektronisk simuleringsanalyse viser at kombinasjonen av IDT N-gen-positiv kontrollmal ** og det amerikanske CDC-testsettet ligner bruken av primer / sondesett fra det kinesiske CDC, det thailandske helsedepartementet og HKU. Resultatene oppnådd av eksperimentet er konsistente. Dette er selvfølgelig basert på elektronisk simuleringsundersøkelse, og det anbefales at brukere verifiserer det valgte settet i sitt eget laboratorium.

For mer informasjon, besøk www.idtdna.com/pages/landing/coronavirus-research-reagents